【回答】 Jw_cadの古いバージョン(Ver.4.03g以前)では、PDFファイルが小さく印刷(保存)されるという不具合がありましたが、現在のバージョンではすでに改善されています。
Jw_cadから直接PDFの作成は出来ないので、なんらかのソフトをインストールし「印刷」コマンドにて出力した際の現象かと思います。「印刷」の際の印刷範囲を再度確認し、PDF作成用のソフトの設定を確認下さい。Jw_cadからフリーソフトの「PrimoPDF」を使ったPDFの作成方法はエクスナレッジムック『実務最優先!Jw_cad4ベストテクニック30』のP.206~214にて詳しく解説されていますので、参考にしてください。